Il percorso del museo è diviso in tre macro sezioni:

• una dedicata al tema della relegazione e della reclusione per ragioni politiche o di appartenenza religiosa nel Piemonte moderno
• un’altra riguarda la storia del carcere in generale e presenta in 5 capitoli la storia del carcere moderno nel mondo occidentale (il potere disciplinare, il corpo esaminato, pane e acqua, le mura della prigione, guardie e ladri). Mentre il corridoio è dedicato ai rapporti tra carcere e mondo dell’arte (cinema, letteratura, pittura, fumetti etc.)
• nella terza viene ricostruita la storia del carcere di Saluzzo dalla sua inaugurazione il 9 dicembre 1828 sino alla sua chiusura nel luglio del 1992